Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NifkQ91VE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NifkQ91VE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NifkQ91VE6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms