Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam20bQ8VCS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam20bQ8VCS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam20bQ8VCS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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