Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdf3Q8BYK6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ythdf3Q8BYK6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdf3Q8BYK6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ythdf3Q8BYK6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms