Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC51.49■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.49■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.49■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC51.49■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
NischQ80TM9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC51.41■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC51.4■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
NischQ80TM9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC51.37■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC51.36■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC51.36■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC51.33■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC51.33■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
NischQ80TM9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
NischQ80TM9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
NischQ80TM9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
NischQ80TM9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
NischQ80TM9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
NischQ80TM9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC51.16■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC51.14■■■■■ 5.78
NischQ80TM9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NischQ80TM9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC51.12■■■■■ 5.77
NischQ80TM9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
NischQ80TM9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
NischQ80TM9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
NischQ80TM9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
NischQ80TM9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
NischQ80TM9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC51.06■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.06■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC51.06■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC51.04■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC51.02■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC51.02■■■■■ 5.76
NischQ80TM9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC51■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.97■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
NischQ80TM9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
NischQ80TM9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
NischQ80TM9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
NischQ80TM9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.92■■■■■ 5.74
NischQ80TM9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC50.92■■■■■ 5.74
NischQ80TM9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
NischQ80TM9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
NischQ80TM9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC50.84■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC50.84■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
NischQ80TM9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
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