Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcl2Q78Y63 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcl2Q78Y63 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcl2Q78Y63 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdcl2Q78Y63 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcl2Q78Y63 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms