Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnih3Q6ZWS4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnih3Q6ZWS4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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