Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip1Q6QD59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip1Q6QD59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip1Q6QD59 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip1Q6QD59 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip1Q6QD59 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip1Q6QD59 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip1Q6QD59 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip1Q6QD59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip1Q6QD59 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms