Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Foxd1Q61345 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Foxd1Q61345 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Foxd1Q61345 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxd1Q61345 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxd1Q61345 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Foxd1Q61345 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms