Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
B230104I21RikQ3USW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
B230104I21RikQ3USW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B230104I21RikQ3USW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B230104I21RikQ3USW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
B230104I21RikQ3USW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B230104I21RikQ3USW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
B230104I21RikQ3USW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B230104I21RikQ3USW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms