Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
TchpQ3TVW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,31■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
TchpQ3TVW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
TchpQ3TVW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,2■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,19■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
TchpQ3TVW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,08■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
TchpQ3TVW5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23,08■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,08■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,06■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
TchpQ3TVW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
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