Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klrb1Q0ZUP1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klrb1Q0ZUP1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klrb1Q0ZUP1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klrb1Q0ZUP1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klrb1Q0ZUP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms