Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcf7Q00417 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcf7Q00417 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf7Q00417 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms