Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa10P50708 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa10P50708 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa10P50708 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa10P50708 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa10P50708 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa10P50708 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa10P50708 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa10P50708 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms