Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl5P47962 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl5P47962 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl5P47962 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl5P47962 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl5P47962 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms