Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klf1P46099 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klf1P46099 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klf1P46099 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klf1P46099 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klf1P46099 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klf1P46099 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf1P46099 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klf1P46099 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf1P46099 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms