Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6fP35460 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly6fP35460 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ly6fP35460 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6fP35460 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6fP35460 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms