Protein–RNA interactions for Protein: P32648

Vip, VIP peptides, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VipP32648 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VipP32648 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VipP32648 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VipP32648 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VipP32648 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VipP32648 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VipP32648 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VipP32648 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VipP32648 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VipP32648 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VipP32648 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VipP32648 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VipP32648 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VipP32648 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VipP32648 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VipP32648 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VipP32648 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VipP32648 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VipP32648 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VipP32648 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VipP32648 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VipP32648 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VipP32648 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VipP32648 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VipP32648 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VipP32648 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VipP32648 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VipP32648 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VipP32648 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VipP32648 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VipP32648 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VipP32648 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VipP32648 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VipP32648 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VipP32648 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VipP32648 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VipP32648 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VipP32648 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VipP32648 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VipP32648 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VipP32648 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VipP32648 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VipP32648 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VipP32648 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VipP32648 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VipP32648 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VipP32648 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VipP32648 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VipP32648 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VipP32648 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VipP32648 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VipP32648 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VipP32648 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VipP32648 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VipP32648 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VipP32648 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VipP32648 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VipP32648 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VipP32648 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VipP32648 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VipP32648 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VipP32648 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VipP32648 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VipP32648 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VipP32648 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VipP32648 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VipP32648 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VipP32648 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VipP32648 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VipP32648 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VipP32648 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VipP32648 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VipP32648 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VipP32648 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VipP32648 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VipP32648 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VipP32648 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VipP32648 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VipP32648 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VipP32648 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VipP32648 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VipP32648 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VipP32648 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VipP32648 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VipP32648 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VipP32648 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms