Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ndufb1P0DN34 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ndufb1P0DN34 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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