Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
BlmO88700 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
BlmO88700 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
BlmO88700 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BlmO88700 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BlmO88700 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
BlmO88700 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
BlmO88700 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
BlmO88700 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BlmO88700 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
BlmO88700 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BlmO88700 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BlmO88700 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
BlmO88700 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BlmO88700 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BlmO88700 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BlmO88700 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
BlmO88700 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
BlmO88700 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BlmO88700 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BlmO88700 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BlmO88700 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BlmO88700 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
BlmO88700 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
BlmO88700 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
BlmO88700 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
BlmO88700 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
BlmO88700 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BlmO88700 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
BlmO88700 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
BlmO88700 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
BlmO88700 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BlmO88700 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BlmO88700 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BlmO88700 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BlmO88700 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
BlmO88700 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BlmO88700 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BlmO88700 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
BlmO88700 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
BlmO88700 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BlmO88700 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
BlmO88700 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
BlmO88700 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
BlmO88700 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
BlmO88700 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
BlmO88700 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BlmO88700 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BlmO88700 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
BlmO88700 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
BlmO88700 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BlmO88700 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
BlmO88700 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
BlmO88700 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
BlmO88700 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
BlmO88700 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
BlmO88700 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BlmO88700 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
BlmO88700 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BlmO88700 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
BlmO88700 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
BlmO88700 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
BlmO88700 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
BlmO88700 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
BlmO88700 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
BlmO88700 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BlmO88700 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BlmO88700 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BlmO88700 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BlmO88700 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
BlmO88700 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BlmO88700 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BlmO88700 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BlmO88700 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BlmO88700 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BlmO88700 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
BlmO88700 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms