Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm20878L7N244 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20878L7N244 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20878L7N244 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20878L7N244 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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