Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2035J3QP87 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2035J3QP87 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2035J3QP87 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2035J3QP87 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm2035J3QP87 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2035J3QP87 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms