Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8127E9Q0P0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8127E9Q0P0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8127E9Q0P0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8127E9Q0P0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms