Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Galntl6E5D8G1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Galntl6E5D8G1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Galntl6E5D8G1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Galntl6E5D8G1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Galntl6E5D8G1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms