Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pramef20B1ARV6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pramef20B1ARV6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef20B1ARV6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef20B1ARV6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms