Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms