Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NME3Q13232 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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