Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms