Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms