Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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LRRTM2O43300 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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LRRTM2O43300 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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