Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms