Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms