Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SYNE4Q8N205 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SYNE4Q8N205 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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SYNE4Q8N205 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYNE4Q8N205 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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