Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRGP23470 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms