Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Speer3W4VSP1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Speer3W4VSP1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Speer3W4VSP1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Speer3W4VSP1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms