Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms