Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms