Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Homer1Q9Z2Y3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms