Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U0

Psma7, Proteasome subunit alpha type-7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma7Q9Z2U0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma7Q9Z2U0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma7Q9Z2U0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma7Q9Z2U0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms