Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms