Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms