Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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