Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms