Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms