Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms