Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Cldn6Q9Z262 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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