Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms