Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RfxankQ9Z205 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RfxankQ9Z205 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RfxankQ9Z205 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RfxankQ9Z205 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RfxankQ9Z205 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RfxankQ9Z205 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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