Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms