Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stk39Q9Z1W9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stk39Q9Z1W9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms