Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms